Collinsella aerofaciens ATCC 25986

 当前命名  Collinsella aerofaciens
 曾用名  Eubacterium aerofaciens
 ATCC编号  25986
 株号  VPI 1003
 其他保藏编号  DSM 3979, JCM 10188, CCUG 28087, KCTC 3647, NCTC 11838
 模式菌株  是
 生物安全等级  BSL 1
分离来源  人类粪便 (Feces)
 保藏者  WE Moore
 宿主  人类
 特殊收藏  NIH人类微生物组计划 (HMP) 参考菌株
 培养条件 温度 37°C
气体 厌氧
培养基 ATCC Medium 2107 (Modified Reinforced Clostridial Broth)
ATCC Medium 260 (Trypticase soy agar with defibrinated sheep blood)
基因组信息 登录号 GenBank: AAVN02000000
基因组大小 2,453,075 bp
测序技术 Illumina + Oxford Nanopore 混合组装
重叠群 3个(全环化)
GC含量 60.6%
N50 2,425,965 nt
CDS 2,121个
tRNA 58个
rRNA 5S: 5个 / 16S: 5个 / 23S: 5个
覆盖度 Illumina 264×