菌种名称 |
Clostridium scindens |
菌株编号 |
ATCC 35704 |
分类地位 |
厚壁菌门(Firmicutes)、梭菌纲(Clostridia)、梭菌目(Clostridiales)、梭菌科(Clostridiaceae)。 |
分离来源 |
人类粪便。 |
基因组信息 |
全基因组测序已完成,基因组大小为3,658,040 bp,包含3,657个编码序列(CDS)、12个rRNA基因和58个tRNA基因。 |
形态与特性 |
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形态特征 |
革兰氏阳性菌(G+),厌氧杆菌,非运动性,单个或成链状存在,芽孢为末端。 |
代谢特性 |
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胆汁酸代谢 |
是主要的胆汁酸7α-去羟基化厌氧菌之一,能够将胆酸(CA)转化为脱氧胆酸(DCA)。 |
发酵特性 |
在发酵葡萄糖时,主要产生乙醇、乙酸、甲酸和氢气。 |
营养需求 |
需要色氨酸、核黄素、泛酸和吡哆醇作为生长因子。 |
生长条件 |
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培养基 |
改良的定义培养基(DM),需添加色氨酸、核黄素、泛酸和吡哆醇。 |
培养温度 |
37℃。 |
培养环境 |
严格厌氧。 |
用途 |
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微生物学研究 |
用于研究胆汁酸代谢、肠道微生物组功能以及微生物与宿主的相互作用。 |
疾病研究 |
与结肠中次级胆汁酸增加相关的疾病研究。 |
培养与保存 |
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复苏方法 |
在厌氧条件下,用约0.5 mL的改良培养基溶解冻干菌粉。 |
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将溶解后的菌液接种到培养基中,或接种至血琼脂平板或斜面培养基上。 |
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在37℃厌氧环境中培养。 |
保存条件 |
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冻干菌株 |
2℃至8℃保存。 |
活化菌株 |
建议在-80℃超低温冰箱中保存。 |
特殊说明 |
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基因组分析 |
基因组测序揭示了其胆汁酸代谢相关的基因簇(bai regulon),并且在胆酸诱导下,这些基因的表达显著上调。 |
转录组分析 |
RNA-Seq分析表明,该菌株在胆酸和脱氧胆酸诱导下表现出复杂的基因表达差异,涉及DNA修复、氧化应激、细胞壁代谢等。 |