Clostridium scindens ATCC 35704

菌种名称 Clostridium scindens
菌株编号 ATCC 35704
分类地位 厚壁菌门（Firmicutes）、梭菌纲（Clostridia）、梭菌目（Clostridiales）、梭菌科（Clostridiaceae）。
分离来源 人类粪便。
基因组信息 全基因组测序已完成，基因组大小为3,658,040 bp，包含3,657个编码序列（CDS）、12个rRNA基因和58个tRNA基因。
形态与特性  
形态特征 革兰氏阳性菌（G+），厌氧杆菌，非运动性，单个或成链状存在，芽孢为末端。
代谢特性  
胆汁酸代谢 是主要的胆汁酸7α-去羟基化厌氧菌之一，能够将胆酸（CA）转化为脱氧胆酸（DCA）。
发酵特性 在发酵葡萄糖时，主要产生乙醇、乙酸、甲酸和氢气。
营养需求 需要色氨酸、核黄素、泛酸和吡哆醇作为生长因子。
生长条件  
培养基 改良的定义培养基（DM），需添加色氨酸、核黄素、泛酸和吡哆醇。
培养温度 37℃。
培养环境 严格厌氧。
用途  
微生物学研究 用于研究胆汁酸代谢、肠道微生物组功能以及微生物与宿主的相互作用。
疾病研究 与结肠中次级胆汁酸增加相关的疾病研究。
培养与保存  
复苏方法 在厌氧条件下，用约0.5 mL的改良培养基溶解冻干菌粉。
  将溶解后的菌液接种到培养基中，或接种至血琼脂平板或斜面培养基上。
  在37℃厌氧环境中培养。
保存条件  
冻干菌株 2℃至8℃保存。
活化菌株 建议在-80℃超低温冰箱中保存。
特殊说明  
基因组分析 基因组测序揭示了其胆汁酸代谢相关的基因簇（bai regulon），并且在胆酸诱导下，这些基因的表达显著上调。
转录组分析 RNA-Seq分析表明，该菌株在胆酸和脱氧胆酸诱导下表现出复杂的基因表达差异，涉及DNA修复、氧化应激、细胞壁代谢等。

细菌

古菌

质粒

真菌和酵母菌

噬菌体

蓝藻

特色菌种